Õppeaine 'Mikrobioloogia ja nakkushaiguste diagnostika'

Aasta:   2013/2014    2014/2015    2015/2016    2016/2017    2017/2018    

Omandab teadmised tähtsamatest bakter-, viirus-, prioon-, seen-, parasitaarnakkuste tekitajatest, omab ülevaadet laboris tehtavatest uuringutest. Teab keskkonna reostumise võimalusi. Oskab võtta, transportida ja töötada nakkusliku materjaliga. Samuti omandab teadmised Eestis levinud ja maailmas enam tuntud parasiitidest, nende ökoloogiast, epidemioloogiast, parasitooside kliinilisest pildist, diagnoosimisest. Õpib tundma parasiitide diagnostilisi tunnuseid ja nende alusel parasiite eristama. Üliõpilane saab selgeks parasitoloogilised uuringumeetodid ja teadmised nakkushaiguste diagnoosimise kaasaegsete meetodite töötamise põhimõtetetest ning võimalustest.

Üliõpilane:
1. omab ülevaadet erinevate mkroobide morfoloogiast, antigeensest ehitusest, kulturaalsetest ja biokeemilistest omadustest, patogeneesist, laboratoorse diagnostika võimalustest
2. tunneb viirus-, prioon- ja enam esinevaid seennakkusi, esinemissagedust ja uuringumeetodeid
3. oskab võtta ja saata materjali uuringuks aeroobsete ning anaeroobsete mikroobide, seen- ja viirusinfektsioonide esinemise kahtluse korral ning omab ülevaadet vastavatest laboratoorsetest uuringutest
4. viib läbi mikrobioloogialaboris enamkasutatavaid bakterioskoopilisi, bakterioloogilisi, immunoloogilisi ja molekulaarbioloogilisi analüüse
5. teab ja oskab kasutada parasitoloogiaalaseid termineid
6. teab parasiitide levikuteid ja profülaktikat ning levikut Eestis ja maailmas
7. tunneb ja oskab eristada käsitletud parasiitide diagnostilisi järke ja nende diagnostilisi tunnuseid
8. teab ja oskab teostada levinumaid parasitoloogilisi uuringuid, oskab ohutult laboris töötada, tunneb laboridokumentatsiooni haldamist
9. osaleb meeskonnatöös, teab kvaliteedikontrolli protsessi parasitoloogias

Grampositiivsed ja gramnegatiivsed kokid
Enterobakterite sugukond
Gramnegatiivsed aeroobsed mittefermenteerivad bakterid
Vibrioonide sugukond
Gramnegatiivsed fak. aeroobsed ja anaeroobsed kokkbakterid
Tähtsamad grampositiivsed eosteta pulkbakterid
Mükobakterid
Aeroobsed aktinomütseedid ja legionellad
Anaeroobid - eostega, eosteta
Zoonoosid
Klamüüdiad, spiroheedid, mükoplasmad,riketsioosid
Seeninfektsioonid
Viirusinfektsioonid
Bakterioskoopiline uuring
Serodiagnostika
Molekulaardiagnostka - tavalisemad molekulaardiagnostika meetodid: polümeraasahelreaktsioon (PCR), selle erinevad variandid, eelised ja puudused võrreldes klassikaliste mikrobioloogiliste meetoditega
Molekulaardiagnostika - PCR. Geelelektroforees. Restriktsioonanalüüs. Hübridisatsioonil põhinevad meetodid. Erinevad molekulaardiagnostiliste meetodite rakendused nakkushaiguste diagnostikas
Molekulaardiagnostika - sissejuhatus molekulaarbioloogia labori töösse: ohutustehnika, töövahendid, aparatuur. PCR reaktsioon bakterirakkudest.
Molekulaardiagnsotika - geelelektroforees. Inimese suuõõne epiteeli lüüs ning PCR.
Ülevaade parasiitidest ja parasitoloogilistest mõistetest
Seedekulgla parasiitsed protistid
Teiste kudede parasiitsed protistid
Imiussid
Paelussid
Ümarussid
Parasiitide laboratoorne diagnostika, uuringumeetodid, uuringumaterjalide kogumine, diagnostilised tunnused, parasiitide eristamine preparaatides

Eristav hindamine

Mikelsaar, Marika; Karki, Tõnis. 2000. Meditsiiniline mikrobioloogia. II osa. Tartu: TÜ Kirjastuse trükikoda, 256 lk.
Mikelsaar, Marika; Mändar, Reet. 1998. Kliinilise mikrobioloogia käsiraamat. Tallinn: Medicina, 363 lk.
Siigur, Urmas; Ora, Ene. 2006. Ühendlabori käsiraamat III. Sihtasutus TÜ Kliinikum, 394 lk.
Greenwood, David; Slack, Richard C. B.; Peutherer, John F. 2002. Medical microbiology. China. Churchill Livingstone, 709 pp.
Koneman, Elmer W; Allen, Stephen D; Janda, William M. jt. 1997. Color atlas and textbook of Diagnostic Microbiology. Philadelphia New York Lippicott,1395 pp.
Baron, Ellen Jo; Finegold, Sidney M. 1990. Bailey and Scott’s Diagnostic Microbiology. The C.V. Mosby Company St. Louis, Baltimore, Philadelphia, Toronto, 861 pp

A. Jõgiste, T. Trei, V. Pool. 1994. Inimese parasiithaigused.Tln.
R. Masso, A. Saag, M. Masso, U. Kokassaar, I. Kalev (koostajad). 1998. Bioloogia praktikum II. Tartu.
Parasitoloogia atlased, erinevad mikrobioloogia õpikud ja interneti leheküljed parasiitide piltide ja elutsüklitega.
M. Remm Parasitoloogia konspekt
Snustad, Simmons "Principles of Genetics", USA, Wiley

2015: TK  

2014: TK  

2013: TK