Õppeaine 'Geneetika ja molekulaardiagnostika 1'

Aasta:   2016/2017    2017/2018    2018/2019    2019/2020    2020/2021    

Üliõpilane:
1. saab aru päriliku info olemusest ja päriliku info realiseerumisest;
2. teab peamisi tänapäeval molekulaardiagnostika laboris kasutusel olevaid meetodeid ja saab aru nende töö põhimõttest.
3. on omandanud praktilised oskused elementaarsete

1. Sissejuhatus ainesse, erinevate infoallikate tutvustamine, DNA, RNA ja valgud, nende olemus, omavaheline seos je geneetilise info realiseerumine nende läbi. Geneetikat puudutavad põhimõisted
2. Geenide olemus, geeniekpressioon, mutatsioonid
3. Mikroobigeneetika, mikroorganismide genoomi eripärad, mobiilsed geneetilised elemendid, horisontaalne geeni ülekanne
4. Molekulaardiagnostika laboris enim kasutatavad meetodid - PCR, genotüpiseerimine, sekveneerimine, Southern blot, Northern blot, Western blot
5. Patogeenide diagnostika, isotermaalsed amplifikatsiooni meetodid, DNA mikrokiibid, DNA analüüs massspektromeetria abil jne.
6. Mendeli ja Morgani seadused, mitoos ja meioos, kromosoomid, inimgeneetika
7. Genoommutatsioonid, kromosoomimutatsioonid, kromosoomihaigused
8. Soo määramine, X-kromosoomi inaktivatsioon, suguliitelised, kromosoomhaigused, diagnostika

Praktikumid:
1. praktikum: Geneetika ülesannete lahendamine
2. praktikum: Bioinformaatika, erinevate molekulaarbioloogiliste programmide tutvustamine
3.praktikum: Bioinformaatika, oligote disainimine tudengi valitud geenile, spetsiifilisuse kontroll
4 -5. praktikum:Bakteriaalse DNA (genoomne ja plasmiidne) eraldamine (klassikalised meetodid, fenool-kloroform töötlus, aluseline ja ensümaatiline lüüs)
6. praktikum: inimese enoomse DNA eraldamine
7. praktikum: Restriktsioonanalüüs,geel elektroforees, tulemuste analüüs
8. praktikum:PCR (inimese genoomselt DNA-lt) CCR5-Delta 32 mutatsioon
9. praktikum:16S rDNA PCR (bakterite genoomsest DNA-st),
10-11. praktikum: PCR dekontamineerimine, vigade otsimine PCR reagentidest, kuidas testida PCR reagente
11. praktikum: REP- ja RAPD PCR metoodikad, REP-PCR genoomsest (bakteri) DNA-st
12. praktikum: Oligonukleotiidide välimistesse otstesse restriktsiooni saitide disainimine (veebiprogrammide kaasabil)
13. praktikum: REP-PCR elektroforees, analüüs digitaalselt arvutiprogrammide abil

Mitteeristav hindamine

Snustad, Simmons. 2003. Principles of Genetics Ed. 3. USA, Wiley
Maimets. 1999. Molekulaarne rakubioloogia.

2009: BA  BA-TLN